انعكاسات المتحور الناشئ من SARS-CoV-2: الحذر هو المفتاح

الملخص

تمت ترجمة أجزاء من هذه الصفحة آلياً وقد تحتوي على أخطاء.

تخضع الفيروسات لتطور مستمر بسبب الانتقاء الطبيعي. على وجه الخصوص، تتغير الفيروسات RNA بمعدلات عالية بشكل متزايد مقارنة بالفيروسات DNA. كلما زادت الفرص المتاحة لانتشار الفيروس، زادت احتمالية رؤية طفرات جديدة. بينما تكون معظم الطفرات إما ضارة أو محايدة، قد تؤدي بعض الطفرات إلى ظهور فيروس أكثر ملاءمة. قد تجعل بعض الطفرات الفيروس أكثر عدوى، وأكثر قابلية للانتقال، أو أكثر ضراوة - مثال على ذلك هو زيادة العدوى لفيروس إيبولا خلال تفشي 2013-2016. يُعتقد أن جائحة COVID-19 الحالي قد انتشر بشكل أسرع من أي تفشي مرض آخر في المئة عام الماضية. لقد أصاب بالفعل أكثر من 95 مليون شخص وتسبب في وفاة أكثر من 2 مليون شخص. تسبب هذا الوباء في متلازمة التنفس الحادة الشديدة فيروس كورونا-2 (SARS-CoV-2)، والذي يشبه SARS-CoV ولكن مع اختلافات جينية رئيسية. يُعتقد أن كلا الفيروسين قد نشأ في الخفافيش. منذ بداية جائحة COVID-19، أظهر SARS-CoV-2 تباينًا. بعد فترة وجيزة من ظهوره، كان الباحثون يراقبون عن كثب تنوع SARS-CoV-2 الجيني في الوقت الحقيقي، على عكس أي فيروس آخر في التاريخ. تم اكتشاف العديد من الطفرات بالفعل، لكن الغالبية منها محايدة في التأثير أو ليس لها تأثير كبير على الفيروس. واحدة من الاستبدالات الملحوظة التي ظهرت في وقت مبكر خلال الوباء هي D614G في البروتين الشوكي. طفرة أخرى في البروتين الشوكي هي Y453F، التي انتشرت بشكل أوسع في المنك والبشر في هولندا والدنمارك. أثارت هذه الطفرات اهتمامًا وقلقًا بشأن تأثيرها المحتمل على الفيروس ومسار الوباء. في 14 ديسمبر 2020، أبلغت السلطات في المملكة المتحدة عن سلالة جديدة من SARS-CoV-2 تم تصنيفها كنوع مثير للقلق (VOC) 202012/01 وسميت لاحقًا B.1.1.7. أصبحت هذه السلالة شائعة جدًا في لندن وجنوب شرق إنجلترا، كما أفاد ائتلاف COVID-19 Genomics UK. تحمل سلالة B.1.1.7 عددًا أكبر من التغيرات الجينية للفيروس وتختلف عن سلالة SARS-CoV-2 الأصلية من ووهان بـ 29 استبدال نوكليوتيد، وهو أعلى من التقديرات الحالية للساعة الجزيئية التي تبلغ استبدالين نوكليوتيد لكل جينوم في الشهر. تم جمع أول جينومين تم أخذ عينات منهما ينتميان إلى هذه السلالة خلال الأسبوع الأخير من سبتمبر 2020 في كينت وغرب لندن. زادت حالات الإصابة بـ B.1.1.7 بسرعة في التكرار في المملكة المتحدة حتى أوائل ديسمبر 2020 واستبدلت السلالات الفيروسية الأخرى في هذه المنطقة الجغرافية. تحتوي سلالة B.1.1.7 على 14 طفرة غير مرادفة (تغيرات في الأحماض الأمينية) وستة مرادفات (غير تغيرات في الأحماض الأمينية) وثلاثة حذف. كما أنها تختلف في النشوء والتطور عن فيروس SARS-CoV-2 المتداول في المملكة المتحدة عندما تم اكتشاف السلالة. يتضمن هذا التباين الجيني عدة طفرات في البروتين الشوكي (حذف 69-70، حذف 144، N501Y، A570D، D614G، P681H، T716I، S982A، وD1118H) بالإضافة إلى طفرات في مناطق جينية أخرى. يقع استبدال N501Y في البروتين الشوكي في منطقة ارتباط المستقبلات التي يستخدمها الفيروس للاندماج مع إنزيم تحويل الأنجيوتنسين 2 البشري لغزو خلايا المضيف. في الوقت نفسه، يُبلغ عن أن 69/70del تؤثر على أداء بعض اختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل التشخيصية التي تستهدف جين S (المعروفة باسم فقدان جين S)، والتي يمكن استخدامها كبديل للكشف عن سلالة B.1.1.7 في غياب القدرة على تسلسل الجينوم. تشير النمذجة الوبائية الأولية، والنتائج النشوء والتطور، والنتائج السريرية إلى أن سلالة B.1.1.7 لديها قابلية انتقال أعلى مقارنة بالسلالات الأخرى. ومع ذلك، تشير هذه التقارير إلى عدم وجود تغيير كبير في شدة المرض أو خطر إعادة العدوى مع السلالة الجديدة مقارنةً بالفيروسات الأخرى SARS-CoV-2 المتداولة في المملكة المتحدة. تأثير طفرات البروتين الشوكي، وخاصة تلك التي تحمل استبدالات مكشوفة على السطح مثل S501Y، على فعالية اللقاحات هو موضع قلق. ومع ذلك، أظهرت البيانات المطمئنة أن مصل المتلقين للقاح BNT162b2 يمتلك عناوين مشابهة من الأجسام المضادة المحايدة ضد كل من SARS-CoV-2 المتجانسة S501 وY501. لذلك، قد يتطلب الأمر من الفيروس عدة طفرات لتتجمع في البروتين الشوكي لتفادي المناعة الناتجة عن اللقاح. ومع ذلك، على الرغم من احتمال فعالية اللقاح ضد السلالات الجديدة، قد تحتاج اللقاحات إلى التحديث مع حدوث المزيد من الطفرات مع مرور الوقت. اعتبارًا من 30 ديسمبر 2020، تم الإبلاغ عن سلالة B.1.1.7 في 31 دولة/إقليم/منطقة أخرى في خمسة من ستة مناطق منظمة الصحة العالمية. إن المراقبة المستمرة والرصد الجيني لفيروس وبائي ناشئ، مثل SARS-CoV-2، له أهمية قصوى للصحة العامة لتمكين الاحتواء السريع وضمان فعالية اللقاحات والأدوية المضادة للفيروسات في ضوء السلالات المتطورة. ومع ذلك، لكي تكون هذه الأداة فعالة ومفيدة، يجب أن تكون البيانات تمثيلية وفي الوقت المناسب. اعتبارًا من 1 يناير 2021، بلغ عدد تسلسلات SARS-CoV-2 عالية التغطية 3341 من منطقة البحر الأبيض المتوسط الشرقية (EMR) في قاعدة بيانات المبادرة العالمية لمشاركة بيانات إنفلونزا الطيور (GISAID)، مما يمثل أكثر من ضعف الزيادة في عدد التسلسلات المتاحة في 12 نوفمبر 2020. بشكل عام، لا تعكس عدد العينات المتسلسلة الزيادة في الإبلاغ عن الحالات المؤكدة مع مرور الوقت في دول EMR. في الواقع، تم جمع 19.1% فقط من التسلسلات من أكتوبر حتى ديسمبر، والتي نشأت حصريًا من خمس دول EMR، principalmente الأردن والبحرين والمغرب. والأكثر إثارة للقلق، أن الغالبية (72.2%) من التسلسلات الجديدة المقدمة بعد 12 نوفمبر كانت من الأشهر السابقة، مما يدل على تأخير كبير في تقديم التسلسل لمعظم دول EMR. كانت الدول الثلاث في EMR التي لديها أكبر عدد من الفيروسات المتسلسلة (أي الإمارات العربية المتحدة، المملكة العربية السعودية، والأردن) لديها متوسط تأخير يتراوح بين شهرين إلى أربعة أشهر بين أخذ عينات الفيروس وبيانات التسلسل التي أصبحت متاحة للجمهور، مع وجود الأردن لديه أقصر تأخير في نشر التسلسل. لم يكن هناك أيضًا فرق في متوسط التأخيرات في نشر التسلسل في هذه الدول الثلاث خلال المرحلة المبكرة والمتأخرة من الوباء (أول وآخر تسلسلات تم جمعها). كانت التسلسلات في بقية دول EMR متقطعة طوال الوباء وبالتالي لم تكن مفيدة جدًا للصحة العامة بطريقة مناسبة. يبرز هذا التحدي في مشاركة بيانات SARS-CoV-2 في الوقت المناسب والمفتوحة وبالتالي الكشف عن سلالات جديدة في EMR، مما يعيق الاستجابة الإقليمية الفعالة. في تحليل حديث لـ 1414 تسلسل SARS-CoV-2 عالي التغطية المتاحة من دول EMR، حددنا 10 استبدالات كانت شائعة في المنطقة. كان اثنان من هذه الطفرات، D614G في البروتين الشوكي وP323L في NSP12، قد تطورا معًا وكانت ممثلة بشكل كبير في هذه الدول. تم تداول الكثير من التكهنات في وسائل الإعلام وبين الجمهور بشأن ظهور سلالات أكثر قابلية للانتقال أو أكثر فتكًا في المنطقة. ومع ذلك، جعلت قلة توفر البيانات في الوقت المناسب من الصعب معالجة هذا الكم الزائد من المعلومات بطريقة قائمة على الأدلة. أظهر تحليلنا عدم وجود ارتباط بين معدلات الوفيات الشهرية وأي من الاستبدالات الشائعة المكتشفة في EMR، بما في ذلك D614G في البروتين الشوكي وP323L في NSP12. كما أكدنا على جهود التسلسل غير المتسقة وغير المثلى في معظم دول EMR، خاصة في مناطق النزاع مثل سوريا وليبيا. مع ظهور سلالات جديدة من SARS-CoV-2 على مستوى العالم، فإن القلق الحقيقي هو احتمال ظهور سلالات هروب من اللقاح تتجاوز جهود التطعيم العالمية. على سبيل المثال، تمتلك السلالة الجنوب أفريقية 501Y.V2 استبدال E484K الذي يتجنب الحياد بواسطة بلازما المتعافين من COVID-19. ومع ذلك، فإن الطريقة التي تظهر بها سلالات أكثر عدوى في مناطق جغرافية مختلفة تتطلب أن يكون التركيز الرئيسي هو السيطرة على الوباء المستمر بطرق صحية عامة جيدة. الاعتماد فقط على اللقاحات للسيطرة على الوباء هو عملية طويلة وستستغرق وقتًا أطول بكثير لحماية سكان العالم البالغ عددهم سبعة مليارات نسمة. حتى إذا كانت ضراوة الفيروس غير متغيرة، فإن زيادة بنسبة 70% في العدوى يمكن أن تؤثر بشكل خطير على السكان من خلال زيادة مستويات الاستشفاء والوفيات. في الواقع، يُعتقد أن هذه هي الحالة مع السلالة البريطانية، حيث تم رؤية نمو أسي في الحالات حيث تحل السلالة الجديدة محل السلالة القديمة. مع ظهور سلالات متعددة، هناك حاجة ملحة للاستثمار العالمي في البنية التحتية الأساسية للصحة العامة، حيث تخدم هذه التدابير ليس فقط فيروسًا واحدًا وسلالاته ولكن أيضًا ميكروبات معدية معروفة ومستقبلية أخرى. ستعد الجهود في مراقبة الأمراض، واكتشاف الاست outbreaks، والتواصل بشأن المخاطر، والتعليم الصحي بالإضافة إلى تنفيذ تدخلات غير صيدلانية العالم لمواجهة مسببات الأمراض الحالية وغيرها من مسببات الأمراض ذات الإمكانات الوبائية. في وباء متصاعد مع قدرات مراقبة غير مسبوقة لانتقال الفيروس، يجب على العلماء وخبراء الصحة العامة أيضًا استخدام أدوات التسلسل والمراقبة لتحديد سلالات فيروسية جديدة وتأثيراتها على الانتقال أو الضراوة في نفس الوقت. وهذا يمكّن من الاحتواء السريع للأنواع الفيروسية التي قد تكون أكثر عدوى أو مقاومة للقاحات/الأدوية.

الكلمات المفتاحية